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活动时间:11月6日(周三)19:00

活动地点:生物楼313

主讲人及主要内容:

(一)报告题目:基于随机微分方程的功能作图模型构建及应用

报告人:甘静雯 计算生物学与生物信息学博士研究生

报告内容:根据胡杨F1代杂交群体表型数据,利用所发展的统计模型和计算平台进行分析。根据获取的表型数据选择最佳的随机微分方程进行拟合,根据随机微分方程选择最佳的参数优化方法。然后在功能作图的框架中构建似然函数结合EM算法和卡尔曼滤波的程序获得参数的最大似然估计。临界值使用排列检测方法获得,最终确定影响胡杨生长发育相关的QTLs位点。并利用生物信息学的方法挖掘与此性状相关的候选基因,预测相关基因功能,目的是为后续功能验证提供指导。

(二)报告题目:构建原始卵泡发育的基因调控网络

报告人:王茜 计算生物学与生物信息学博士研究生

报告内容:原始卵泡发育决定女性生殖力储备,发育异常会导致卵巢早衰和不孕症。原始卵泡的发育有多因素参与,受复杂的基因网络调控,构建它的网络模型有助于阐明原始卵泡的发育机制,提高卵泡异常疾病的诊治水平。针对原始卵泡发育的特点,结合常微分方程,利用单细胞测序的转录组信息,构建它的基因调控网络模型。解析该模型,不仅可以获得各基因间互作的模式和效应;还可以获得影响原始卵泡发育的关键基因以及网络间互作对发育的影响。

(三)报告题目:Biopolymer-coated nanoliposomes as carriers of rainbow trout skin-derived antioxidant peptides

报告人:冯艳霞 计算生物学与生物信息学博士研究生

报告内容:在这项研究中,从虹鳟鱼(Oncorhynchus mykiss)皮肤明胶水解产物中分离出的分子量<30kDa(PF30)的抗氧化剂肽组分被封装在壳聚糖包被的纳米脂质体中。含有PF30的脂质体纳米囊的平均粒径在163.4-234 nm 范围内,且多分散指数较低(PDI < 0.5)。此外,ζ电势从未包衣脂质体中的+3.9mV变为在生物聚合物包衣脂质体中的+45.5mV。FTIR光谱显示磷脂头部和壳聚糖的氨基之间通过静电相互作用以及氢键相连接。PF30的包封率在以0.4%(w/v)的壳聚糖包被的纳米脂质体中最高。生物聚合物涂层脂质体在体外显示出更持久的肽释放行为。此外,壳聚糖包衣的纳米脂质体保持了PF30的抗氧化活性,可以被认为是在营养食品和功能食品中有效递送生物活性化合物的潜在候选者。